如来藏心体中含藏七识心等染污种子
阿含部《央掘魔罗经》卷第三：【（佛言）：「我于无量阿僧祇劫恒河沙生，于灯光如来（燃灯佛）所、修菩萨行，闻自受记，随顺于如；不谤经故，生舍宅身。我于无量阿僧祇劫恒河沙生，闻如来藏：一切众生断诸烦恼便得成佛。因其信乐覆护众生，故生覆护身。」】
阿含部《央掘魔罗经》卷第四亦云：【尔时文殊师利语央掘魔罗言：「如来藏者有何义？若一切众生悉有如来藏者，一切众生皆当作佛，一切众生皆当杀、盗、邪淫、妄语、饮酒等不善业迹。何以故？一切众生悉有佛性（此是指成佛之性，非谓眼见佛性所说之佛性），当一时得度。若有佛性者，当作逆罪及一阐提。若有我者我界，当度一切有；是故世间无有『我』，无有『界』；一切法无我，是诸佛教。」佛告文殊师利：「一切众生有如来藏，为无量烦恼覆，如瓶中灯。…」】
阿含部《央掘魔罗经》卷第四 佛云：【「此偈说烦恼义；意法恶者，为无量烦恼所覆，造作诸恶故名为恶。不知自性心如来藏，入无量烦恼义；如是躁浊不息故，若说若作，一切众苦常随不绝。如轮随迹者，诸恶积聚生死轮回，转一切众生于三恶趣中，如轮随迹，是故说『于福迟缓者心乐于恶法』。」】
《大法鼓经》卷下亦如是云：【如瓶中灯焰，其明不现，于众生无用；若坏去瓶，其光普照。如是诸烦恼瓶，覆如来藏灯，相好庄严则不明净，于众生无用。若离一切诸烦恼藏，彼如来性烦恼永尽，相好照明施作佛事，如破瓶灯，众生受用。】
《大萨遮尼干子所说经》卷第九如是载云：【答言：「大王！当依一切众生烦恼身观，当依贪欲瞋恚愚痴众生中观，当依四颠倒见众生中观，当依阴界诸入中观，当依地狱畜生饿鬼乃至阿修罗等诸身中观。何以故？此身即是如来藏故。大王当知：一切烦恼诸垢藏中，有如来性湛然满足，如石中金，如木中火，如地下水，如乳中酪，如麻中油，如子中牙，如藏中宝，如摸中象，如孕中胎，如云中日。是故我言：烦恼身中有如来藏。」】
《大方等如来藏经》云：【「善男子！一切众生虽在诸趣烦恼身中，有如来藏常无染污，德相备足如我无异。又善男子！譬如天眼之人，观未敷花，见诸花内有如来身结加趺坐，除去萎花便得显现。如是善男子！佛见众生如来藏已，欲令开敷，为说经法，除灭烦恼显现佛性。善男子！诸佛法尔，若佛出世、若不出世，一切众生如来之藏常住不变；但彼众生烦恼覆故，如来出世广为说法，除灭尘劳净一切智。」】
《大方等如来藏经》也如是说：【（佛言：）「复次善男子！譬如淳蜜在岩树中，无数群蜂围绕守护；时有一人巧智方便，先除彼蜂乃取其蜜，随意食用惠及远近。如是善男子！一切众生有如来藏，如彼淳蜜在于岩树，为诸烦恼之所覆蔽，亦如彼蜜群蜂守护；我以佛眼如实观之，以善方便随应说法，灭除烦恼、开佛知见，普为世间施作佛事。」尔时世尊以偈颂曰：「譬如岩树蜜，无量蜂围绕；巧方便取者，先除彼群蜂；众生如来藏，犹如岩树蜜，结使尘劳缠，如群蜂守护；我为诸众生，方便说正法，灭除烦恼蜂，开发如来藏；具足无碍辩，演说甘露法，普令成正觉，大悲济群生。」】
《佛说不增不减经》云：【（佛言：）「复次舍利弗！如我上说，众生界中亦三种法，皆真实如，不异不差。何谓三法？一者如来藏本际相应体及清净法，二者如来藏本际不相应体及烦恼缠不清净法，三者如来藏未来际平等恒及有法。」】此段经文亦说，如来藏本际不相应体，即是说，如来藏自身所住境界是不与烦恼相应的，故是自性清净心体；但是却有烦恼缠绕的种种不清净法，即是七识心相应的无量烦恼种子。所以自性清净的如来藏，含藏着不净法种，有智慧的人应当依循圣教，求证现在因地的自性清净而含藏染污法种的如来藏，不应如杨、蔡、莲等人一般，妄想于现在因地就可证得佛地才会有的绝对清净的如来藏、真如。
《佛说不增不减经》亦云：【（佛言：）「舍利弗当知：如来藏本际不相应体及烦恼缠不清净法者，此本际来离脱不相应烦恼所缠不清净法，唯有如来菩提智之所能断。舍利弗！我依此烦恼所缠不相应不思议法界，为众生故，说为客尘烦恼所染自性清净心不可思议法。」】此经文亦说，自性清净的如来藏，有客尘烦恼等种子染污；所以不应在现在因地就妄想证得绝对清净的、不含藏染污法种的果地如来藏。应该依循 佛之圣教，悟后次第修除七识心相应的不净法种││净除二障种子及随眠││然后方可成佛，方可证得佛地无垢识而显示佛地究竟性的真如法性。不可如杨、蔡、莲等人，现在就想证得佛地真如，妄想免掉净除二障种子随眠的悟后修行过程。
又如《无上依经》菩提品第三云：【佛告阿难：「何者如来阿耨多罗三藐三菩提？诸佛婆伽婆在无漏界，一切障永尽，转依寂静明净。是无上菩提，与十种分相应，汝当知；何等为十？一者自性，二者因缘，三者惑障，四者至果，五者作事，六者相摄，七者行处，八者常住，九者不共，十者不可思惟。阿难！何者名为菩提自性？十地十波罗蜜，如理如量修出离道，所得转依寂静明净，声闻缘觉非其境界，是即名为菩提自性。阿难！是界未除烦恼诮，我说名如来藏至极清净，是名转依法有四种相：一者生起缘故，二者灭尽缘故，三者正熟思量所知法果故，四者最清净法界体故。何者名生起缘？出一切世，如来相续，是菩提道生起缘处。何者名灭尽缘？三品烦恼根本种类，依因此法永灭尽故。何者所知法果？已正通达所知真如证得果故。何者名法界体？灭诸相结，最净法界所显现故。阿难！是转依相，是转依者，则佛婆伽婆无上菩提，故名菩提性。」】
《楞伽阿跋多罗宝经》一切佛语心品之二也说：【尔时大慧菩萨摩诃萨白佛言：「世尊！世尊修多罗说如来藏自性清净，转三十二相，入于一切众生身中；如大价宝，垢衣所缠；如来之藏常住不变亦复如是，而阴界入垢衣所缠，贪欲、恚、痴、不实妄想尘劳所污，一切诸佛之所演说。」】
《入楞伽经》佛性品第十一也这样说：【（佛言：）「大慧！此如来心阿梨耶识如来藏诸境界，一切声闻辟支佛诸外道等不能分别，何以故？以如来藏是清净相，客尘烦恼垢染不净。」】
《胜鬘经》法身章第八所云：【「若于无量烦恼藏所缠如来藏不疑惑者，于『出无量烦恼藏』法身亦无疑惑。」】